Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CETPP11597 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CETPP11597 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CETPP11597 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CETPP11597 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CETPP11597 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CETPP11597 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CETPP11597 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CETPP11597 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CETPP11597 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CETPP11597 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CETPP11597 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CETPP11597 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CETPP11597 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CETPP11597 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CETPP11597 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CETPP11597 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CETPP11597 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CETPP11597 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CETPP11597 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CETPP11597 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CETPP11597 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CETPP11597 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CETPP11597 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CETPP11597 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CETPP11597 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CETPP11597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CETPP11597 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CETPP11597 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CETPP11597 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CETPP11597 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CETPP11597 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CETPP11597 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CETPP11597 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CETPP11597 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CETPP11597 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CETPP11597 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CETPP11597 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CETPP11597 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CETPP11597 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CETPP11597 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CETPP11597 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CETPP11597 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CETPP11597 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CETPP11597 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CETPP11597 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CETPP11597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CETPP11597 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CETPP11597 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CETPP11597 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CETPP11597 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CETPP11597 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CETPP11597 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CETPP11597 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CETPP11597 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CETPP11597 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CETPP11597 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CETPP11597 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CETPP11597 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CETPP11597 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CETPP11597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CETPP11597 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CETPP11597 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CETPP11597 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CETPP11597 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CETPP11597 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CETPP11597 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CETPP11597 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CETPP11597 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CETPP11597 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CETPP11597 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CETPP11597 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms