Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBP11277 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBP11277 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBP11277 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBP11277 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBP11277 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBP11277 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBP11277 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBP11277 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBP11277 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBP11277 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBP11277 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBP11277 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBP11277 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBP11277 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBP11277 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBP11277 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBP11277 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBP11277 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBP11277 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBP11277 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBP11277 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBP11277 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBP11277 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBP11277 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBP11277 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBP11277 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBP11277 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBP11277 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBP11277 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBP11277 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBP11277 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBP11277 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBP11277 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBP11277 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBP11277 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBP11277 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBP11277 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBP11277 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBP11277 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBP11277 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBP11277 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBP11277 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBP11277 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBP11277 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBP11277 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBP11277 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms