Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8BP10966 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8BP10966 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8BP10966 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8BP10966 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8BP10966 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8BP10966 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8BP10966 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8BP10966 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8BP10966 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8BP10966 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8BP10966 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8BP10966 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8BP10966 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8BP10966 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8BP10966 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8BP10966 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8BP10966 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8BP10966 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8BP10966 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8BP10966 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8BP10966 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8BP10966 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8BP10966 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8BP10966 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8BP10966 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8BP10966 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD8BP10966 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms