Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP10827 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP10827 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP10827 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP10827 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP10827 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP10827 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRAP10827 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRAP10827 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRAP10827 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THRAP10827 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRAP10827 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRAP10827 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRAP10827 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRAP10827 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THRAP10827 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THRAP10827 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THRAP10827 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THRAP10827 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THRAP10827 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THRAP10827 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THRAP10827 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THRAP10827 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THRAP10827 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THRAP10827 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THRAP10827 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THRAP10827 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP10827 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP10827 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP10827 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP10827 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP10827 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP10827 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP10827 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP10827 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP10827 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP10827 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP10827 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP10827 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP10827 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP10827 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP10827 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP10827 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP10827 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP10827 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP10827 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP10827 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP10827 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP10827 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP10827 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP10827 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP10827 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP10827 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP10827 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP10827 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP10827 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP10827 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP10827 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP10827 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP10827 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP10827 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms