Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN1MW3P0DN78 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms