Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM49P0CI25 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms