Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PABPC4LP0CB38 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms