Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC4P09017 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms