Protein–RNA interactions for Protein: P08670

VIM, Vimentin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIMP08670 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIMP08670 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIMP08670 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIMP08670 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIMP08670 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIMP08670 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIMP08670 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIMP08670 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIMP08670 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIMP08670 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIMP08670 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIMP08670 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIMP08670 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIMP08670 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIMP08670 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIMP08670 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIMP08670 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIMP08670 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIMP08670 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIMP08670 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIMP08670 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIMP08670 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIMP08670 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIMP08670 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIMP08670 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIMP08670 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIMP08670 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIMP08670 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIMP08670 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIMP08670 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIMP08670 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIMP08670 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIMP08670 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIMP08670 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIMP08670 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIMP08670 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIMP08670 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIMP08670 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIMP08670 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIMP08670 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIMP08670 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIMP08670 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIMP08670 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIMP08670 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIMP08670 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIMP08670 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIMP08670 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIMP08670 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIMP08670 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIMP08670 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIMP08670 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIMP08670 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIMP08670 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIMP08670 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIMP08670 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms