Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSBP07858 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSBP07858 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSBP07858 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSBP07858 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSBP07858 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSBP07858 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSBP07858 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSBP07858 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSBP07858 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSBP07858 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSBP07858 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSBP07858 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSBP07858 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSBP07858 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSBP07858 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSBP07858 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSBP07858 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSBP07858 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSBP07858 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSBP07858 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSBP07858 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSBP07858 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSBP07858 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSBP07858 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSBP07858 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSBP07858 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSBP07858 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSBP07858 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSBP07858 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSBP07858 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSBP07858 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSBP07858 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSBP07858 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSBP07858 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSBP07858 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSBP07858 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSBP07858 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSBP07858 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSBP07858 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSBP07858 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSBP07858 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSBP07858 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSBP07858 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSBP07858 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSBP07858 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSBP07858 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSBP07858 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSBP07858 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSBP07858 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSBP07858 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSBP07858 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSBP07858 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSBP07858 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSBP07858 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSBP07858 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSBP07858 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSBP07858 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSBP07858 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSBP07858 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSBP07858 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms