Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CENPBP07199 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CENPBP07199 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CENPBP07199 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CENPBP07199 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CENPBP07199 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CENPBP07199 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CENPBP07199 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPBP07199 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CENPBP07199 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CENPBP07199 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CENPBP07199 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CENPBP07199 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CENPBP07199 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CENPBP07199 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CENPBP07199 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CENPBP07199 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CENPBP07199 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CENPBP07199 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CENPBP07199 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CENPBP07199 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPBP07199 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPBP07199 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPBP07199 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPBP07199 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPBP07199 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPBP07199 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPBP07199 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CENPBP07199 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CENPBP07199 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CENPBP07199 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CENPBP07199 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CENPBP07199 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CENPBP07199 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CENPBP07199 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CENPBP07199 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CENPBP07199 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CENPBP07199 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CENPBP07199 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CENPBP07199 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CENPBP07199 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CENPBP07199 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CENPBP07199 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CENPBP07199 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPBP07199 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPBP07199 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPBP07199 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPBP07199 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPBP07199 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPBP07199 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPBP07199 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPBP07199 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPBP07199 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPBP07199 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPBP07199 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPBP07199 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPBP07199 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPBP07199 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPBP07199 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPBP07199 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPBP07199 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPBP07199 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPBP07199 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPBP07199 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPBP07199 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPBP07199 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPBP07199 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPBP07199 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPBP07199 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPBP07199 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPBP07199 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPBP07199 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPBP07199 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPBP07199 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPBP07199 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPBP07199 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CENPBP07199 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CENPBP07199 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CENPBP07199 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CENPBP07199 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms