Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TFAP2AP05549 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms