Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG5P05408 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG5P05408 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG5P05408 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG5P05408 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG5P05408 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG5P05408 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG5P05408 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG5P05408 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG5P05408 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG5P05408 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG5P05408 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG5P05408 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG5P05408 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG5P05408 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG5P05408 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG5P05408 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG5P05408 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG5P05408 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG5P05408 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG5P05408 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG5P05408 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG5P05408 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG5P05408 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms