Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGF1P05230 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGF1P05230 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGF1P05230 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGF1P05230 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGF1P05230 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGF1P05230 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGF1P05230 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGF1P05230 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGF1P05230 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGF1P05230 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGF1P05230 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGF1P05230 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FGF1P05230 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGF1P05230 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGF1P05230 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGF1P05230 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGF1P05230 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGF1P05230 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGF1P05230 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGF1P05230 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGF1P05230 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGF1P05230 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGF1P05230 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FGF1P05230 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGF1P05230 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGF1P05230 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGF1P05230 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGF1P05230 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGF1P05230 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGF1P05230 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGF1P05230 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGF1P05230 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGF1P05230 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGF1P05230 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGF1P05230 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGF1P05230 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FGF1P05230 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGF1P05230 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGF1P05230 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGF1P05230 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGF1P05230 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGF1P05230 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGF1P05230 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGF1P05230 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGF1P05230 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGF1P05230 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGF1P05230 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGF1P05230 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGF1P05230 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGF1P05230 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms