Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MT-ND2P03891 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ND2P03891 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms