Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA1P02647 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA1P02647 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA1P02647 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOA1P02647 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA1P02647 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA1P02647 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA1P02647 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA1P02647 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA1P02647 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOA1P02647 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOA1P02647 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOA1P02647 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOA1P02647 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOA1P02647 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOA1P02647 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOA1P02647 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOA1P02647 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOA1P02647 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOA1P02647 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOA1P02647 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOA1P02647 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOA1P02647 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOA1P02647 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOA1P02647 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOA1P02647 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOA1P02647 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOA1P02647 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOA1P02647 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOA1P02647 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOA1P02647 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOA1P02647 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOA1P02647 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOA1P02647 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms