Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DQB1P01920 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DQB1P01920 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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