Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRAP01903 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms