Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-HP01893 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-HP01893 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-HP01893 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-HP01893 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms