Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFNA2P01563 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA2P01563 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA2P01563 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms