Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F9P00740 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F9P00740 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F9P00740 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F9P00740 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F9P00740 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F9P00740 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F9P00740 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F9P00740 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F9P00740 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F9P00740 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F9P00740 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
F9P00740 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F9P00740 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F9P00740 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F9P00740 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F9P00740 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F9P00740 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F9P00740 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F9P00740 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
F9P00740 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
F9P00740 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F9P00740 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F9P00740 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F9P00740 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F9P00740 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F9P00740 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F9P00740 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F9P00740 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F9P00740 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F9P00740 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F9P00740 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F9P00740 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F9P00740 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F9P00740 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F9P00740 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
F9P00740 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
F9P00740 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
F9P00740 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
F9P00740 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
F9P00740 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
F9P00740 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
F9P00740 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
F9P00740 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
F9P00740 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
F9P00740 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F9P00740 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F9P00740 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
F9P00740 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F9P00740 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F9P00740 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F9P00740 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
F9P00740 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F9P00740 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F9P00740 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F9P00740 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F9P00740 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
F9P00740 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F9P00740 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P00740 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P00740 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P00740 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P00740 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P00740 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P00740 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P00740 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms