Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC24BO95487 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC24BO95487 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms