Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MBD4O95243 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MBD4O95243 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MBD4O95243 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MBD4O95243 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MBD4O95243 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MBD4O95243 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MBD4O95243 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MBD4O95243 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MBD4O95243 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MBD4O95243 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MBD4O95243 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MBD4O95243 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MBD4O95243 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MBD4O95243 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MBD4O95243 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MBD4O95243 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MBD4O95243 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MBD4O95243 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MBD4O95243 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MBD4O95243 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MBD4O95243 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MBD4O95243 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MBD4O95243 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MBD4O95243 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MBD4O95243 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD4O95243 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD4O95243 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD4O95243 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD4O95243 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD4O95243 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD4O95243 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD4O95243 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD4O95243 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD4O95243 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD4O95243 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD4O95243 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD4O95243 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MBD4O95243 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD4O95243 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD4O95243 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD4O95243 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD4O95243 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD4O95243 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD4O95243 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD4O95243 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD4O95243 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD4O95243 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD4O95243 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD4O95243 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD4O95243 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD4O95243 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MBD4O95243 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MBD4O95243 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MBD4O95243 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MBD4O95243 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MBD4O95243 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MBD4O95243 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MBD4O95243 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MBD4O95243 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MBD4O95243 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MBD4O95243 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MBD4O95243 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MBD4O95243 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MBD4O95243 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MBD4O95243 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MBD4O95243 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MBD4O95243 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MBD4O95243 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MBD4O95243 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MBD4O95243 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MBD4O95243 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MBD4O95243 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MBD4O95243 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MBD4O95243 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms