Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3DO95025 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3DO95025 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3DO95025 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3DO95025 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3DO95025 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3DO95025 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3DO95025 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3DO95025 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms