Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOBTB3O94955 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOBTB3O94955 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms