Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD3O94806 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD3O94806 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms