Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM2O94769 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM2O94769 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ECM2O94769 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM2O94769 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM2O94769 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM2O94769 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ECM2O94769 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM2O94769 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM2O94769 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM2O94769 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM2O94769 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ECM2O94769 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ECM2O94769 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ECM2O94769 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM2O94769 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM2O94769 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM2O94769 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM2O94769 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECM2O94769 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM2O94769 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM2O94769 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM2O94769 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM2O94769 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM2O94769 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM2O94769 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM2O94769 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM2O94769 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM2O94769 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM2O94769 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM2O94769 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM2O94769 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM2O94769 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM2O94769 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM2O94769 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM2O94769 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM2O94769 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM2O94769 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM2O94769 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM2O94769 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM2O94769 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM2O94769 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM2O94769 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM2O94769 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM2O94769 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM2O94769 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM2O94769 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM2O94769 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM2O94769 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM2O94769 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM2O94769 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM2O94769 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM2O94769 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM2O94769 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM2O94769 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM2O94769 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM2O94769 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM2O94769 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM2O94769 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM2O94769 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM2O94769 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM2O94769 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM2O94769 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM2O94769 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM2O94769 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM2O94769 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM2O94769 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM2O94769 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM2O94769 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECM2O94769 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECM2O94769 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM2O94769 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM2O94769 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM2O94769 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms