Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP2O75604 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP2O75604 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP2O75604 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP2O75604 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP2O75604 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP2O75604 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP2O75604 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP2O75604 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP2O75604 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP2O75604 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP2O75604 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP2O75604 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP2O75604 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP2O75604 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP2O75604 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP2O75604 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP2O75604 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP2O75604 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP2O75604 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP2O75604 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP2O75604 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP2O75604 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP2O75604 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP2O75604 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP2O75604 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP2O75604 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP2O75604 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP2O75604 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP2O75604 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP2O75604 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP2O75604 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP2O75604 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP2O75604 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP2O75604 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP2O75604 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP2O75604 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP2O75604 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP2O75604 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP2O75604 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP2O75604 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP2O75604 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP2O75604 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP2O75604 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP2O75604 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP2O75604 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP2O75604 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP2O75604 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP2O75604 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP2O75604 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP2O75604 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP2O75604 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP2O75604 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP2O75604 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP2O75604 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP2O75604 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP2O75604 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP2O75604 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP2O75604 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP2O75604 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP2O75604 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP2O75604 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP2O75604 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP2O75604 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP2O75604 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP2O75604 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USP2O75604 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP2O75604 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USP2O75604 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP2O75604 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP2O75604 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP2O75604 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP2O75604 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP2O75604 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP2O75604 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP2O75604 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP2O75604 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP2O75604 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP2O75604 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms