Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC22BO75396 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.3 ms