Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LRP5O75197 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LRP5O75197 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LRP5O75197 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LRP5O75197 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LRP5O75197 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRP5O75197 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRP5O75197 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRP5O75197 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRP5O75197 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRP5O75197 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRP5O75197 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
LRP5O75197 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
LRP5O75197 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
LRP5O75197 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRP5O75197 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRP5O75197 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRP5O75197 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRP5O75197 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRP5O75197 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRP5O75197 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRP5O75197 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRP5O75197 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRP5O75197 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRP5O75197 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRP5O75197 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
LRP5O75197 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRP5O75197 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRP5O75197 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRP5O75197 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRP5O75197 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LRP5O75197 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LRP5O75197 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRP5O75197 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRP5O75197 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRP5O75197 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRP5O75197 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRP5O75197 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRP5O75197 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRP5O75197 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRP5O75197 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRP5O75197 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRP5O75197 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRP5O75197 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LRP5O75197 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRP5O75197 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRP5O75197 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LRP5O75197 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRP5O75197 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRP5O75197 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRP5O75197 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRP5O75197 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRP5O75197 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LRP5O75197 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRP5O75197 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRP5O75197 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRP5O75197 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRP5O75197 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRP5O75197 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRP5O75197 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRP5O75197 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRP5O75197 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LRP5O75197 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRP5O75197 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRP5O75197 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRP5O75197 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRP5O75197 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRP5O75197 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRP5O75197 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRP5O75197 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRP5O75197 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRP5O75197 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRP5O75197 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRP5O75197 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRP5O75197 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRP5O75197 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms