Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP9AO75110 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP9AO75110 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9AO75110 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9AO75110 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms