Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSCO60682 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MSCO60682 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MSCO60682 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MSCO60682 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MSCO60682 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSCO60682 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MSCO60682 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSCO60682 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSCO60682 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSCO60682 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSCO60682 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSCO60682 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSCO60682 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSCO60682 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSCO60682 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSCO60682 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MSCO60682 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSCO60682 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSCO60682 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSCO60682 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSCO60682 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSCO60682 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSCO60682 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSCO60682 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSCO60682 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSCO60682 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSCO60682 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSCO60682 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MSCO60682 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSCO60682 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSCO60682 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSCO60682 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSCO60682 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSCO60682 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSCO60682 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSCO60682 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSCO60682 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSCO60682 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSCO60682 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSCO60682 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSCO60682 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSCO60682 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSCO60682 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSCO60682 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSCO60682 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSCO60682 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSCO60682 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MSCO60682 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MSCO60682 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSCO60682 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSCO60682 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSCO60682 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSCO60682 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSCO60682 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSCO60682 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSCO60682 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSCO60682 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms