Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX3O60493 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX3O60493 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX3O60493 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX3O60493 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX3O60493 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX3O60493 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX3O60493 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX3O60493 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX3O60493 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX3O60493 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX3O60493 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX3O60493 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX3O60493 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX3O60493 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX3O60493 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX3O60493 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX3O60493 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX3O60493 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX3O60493 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX3O60493 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX3O60493 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX3O60493 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX3O60493 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX3O60493 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX3O60493 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX3O60493 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX3O60493 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX3O60493 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX3O60493 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX3O60493 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX3O60493 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX3O60493 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX3O60493 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX3O60493 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX3O60493 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX3O60493 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX3O60493 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX3O60493 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX3O60493 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX3O60493 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX3O60493 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX3O60493 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX3O60493 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX3O60493 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX3O60493 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX3O60493 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX3O60493 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX3O60493 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX3O60493 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX3O60493 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX3O60493 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX3O60493 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX3O60493 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX3O60493 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX3O60493 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX3O60493 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX3O60493 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX3O60493 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX3O60493 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX3O60493 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX3O60493 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX3O60493 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX3O60493 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX3O60493 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX3O60493 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms