Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCMT2O60294 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms