Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX5O60225 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX5O60225 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX5O60225 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX5O60225 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX5O60225 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX5O60225 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX5O60225 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX5O60225 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX5O60225 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX5O60225 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms