Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA2O43921 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms