Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT86O43790 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT86O43790 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT86O43790 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT86O43790 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT86O43790 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT86O43790 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT86O43790 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT86O43790 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT86O43790 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT86O43790 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT86O43790 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT86O43790 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT86O43790 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT86O43790 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT86O43790 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT86O43790 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT86O43790 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT86O43790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT86O43790 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT86O43790 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT86O43790 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT86O43790 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT86O43790 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT86O43790 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT86O43790 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT86O43790 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT86O43790 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT86O43790 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms