Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGTAO43765 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGTAO43765 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGTAO43765 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGTAO43765 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGTAO43765 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGTAO43765 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGTAO43765 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGTAO43765 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGTAO43765 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGTAO43765 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGTAO43765 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGTAO43765 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGTAO43765 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGTAO43765 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGTAO43765 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGTAO43765 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGTAO43765 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGTAO43765 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGTAO43765 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGTAO43765 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGTAO43765 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGTAO43765 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGTAO43765 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGTAO43765 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGTAO43765 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGTAO43765 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGTAO43765 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGTAO43765 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGTAO43765 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGTAO43765 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGTAO43765 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGTAO43765 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGTAO43765 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGTAO43765 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SGTAO43765 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SGTAO43765 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGTAO43765 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGTAO43765 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGTAO43765 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGTAO43765 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGTAO43765 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGTAO43765 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGTAO43765 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGTAO43765 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGTAO43765 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGTAO43765 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGTAO43765 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGTAO43765 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGTAO43765 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGTAO43765 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGTAO43765 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGTAO43765 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGTAO43765 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGTAO43765 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms