Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BUD23O43709 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BUD23O43709 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BUD23O43709 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BUD23O43709 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BUD23O43709 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BUD23O43709 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BUD23O43709 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BUD23O43709 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BUD23O43709 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BUD23O43709 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BUD23O43709 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BUD23O43709 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BUD23O43709 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BUD23O43709 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BUD23O43709 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BUD23O43709 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BUD23O43709 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BUD23O43709 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BUD23O43709 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BUD23O43709 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BUD23O43709 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BUD23O43709 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BUD23O43709 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BUD23O43709 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BUD23O43709 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BUD23O43709 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BUD23O43709 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BUD23O43709 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BUD23O43709 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BUD23O43709 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BUD23O43709 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BUD23O43709 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BUD23O43709 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BUD23O43709 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms