Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXO3O43524 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FOXO3O43524 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOXO3O43524 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FOXO3O43524 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FOXO3O43524 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms