Protein–RNA interactions for Protein: O43169

CYB5B, Cytochrome b5 type B, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB5BO43169 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYB5BO43169 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYB5BO43169 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYB5BO43169 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms