Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN3O15232 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN3O15232 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MATN3O15232 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN3O15232 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN3O15232 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN3O15232 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN3O15232 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN3O15232 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN3O15232 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN3O15232 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN3O15232 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN3O15232 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN3O15232 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN3O15232 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN3O15232 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN3O15232 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MATN3O15232 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MATN3O15232 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN3O15232 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN3O15232 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN3O15232 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN3O15232 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN3O15232 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN3O15232 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms