Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28O15084 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms