Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCF2LO15068 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms