Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNMO15061 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNMO15061 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYNMO15061 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SYNMO15061 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYNMO15061 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYNMO15061 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYNMO15061 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYNMO15061 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYNMO15061 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYNMO15061 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYNMO15061 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SYNMO15061 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYNMO15061 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYNMO15061 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNMO15061 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SYNMO15061 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SYNMO15061 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SYNMO15061 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SYNMO15061 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SYNMO15061 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNMO15061 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYNMO15061 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYNMO15061 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYNMO15061 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYNMO15061 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYNMO15061 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYNMO15061 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SYNMO15061 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SYNMO15061 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SYNMO15061 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYNMO15061 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYNMO15061 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYNMO15061 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYNMO15061 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYNMO15061 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYNMO15061 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYNMO15061 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SYNMO15061 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SYNMO15061 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SYNMO15061 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SYNMO15061 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYNMO15061 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYNMO15061 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SYNMO15061 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYNMO15061 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYNMO15061 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYNMO15061 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYNMO15061 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYNMO15061 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYNMO15061 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SYNMO15061 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SYNMO15061 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNMO15061 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNMO15061 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNMO15061 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNMO15061 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNMO15061 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNMO15061 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNMO15061 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNMO15061 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNMO15061 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNMO15061 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNMO15061 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNMO15061 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNMO15061 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNMO15061 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNMO15061 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNMO15061 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNMO15061 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNMO15061 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNMO15061 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNMO15061 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNMO15061 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNMO15061 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNMO15061 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNMO15061 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNMO15061 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNMO15061 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNMO15061 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNMO15061 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNMO15061 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms