Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCKDKO14874 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms