Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC80O14777 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC80O14777 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC80O14777 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDC80O14777 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDC80O14777 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDC80O14777 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC80O14777 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC80O14777 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC80O14777 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDC80O14777 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDC80O14777 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDC80O14777 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NDC80O14777 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDC80O14777 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDC80O14777 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC80O14777 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC80O14777 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC80O14777 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC80O14777 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC80O14777 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC80O14777 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDC80O14777 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDC80O14777 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC80O14777 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC80O14777 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC80O14777 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC80O14777 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC80O14777 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC80O14777 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC80O14777 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC80O14777 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC80O14777 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC80O14777 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC80O14777 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC80O14777 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC80O14777 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC80O14777 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC80O14777 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC80O14777 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC80O14777 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC80O14777 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC80O14777 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC80O14777 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC80O14777 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms