Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PODXLO00592 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PODXLO00592 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PODXLO00592 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PODXLO00592 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PODXLO00592 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PODXLO00592 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PODXLO00592 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PODXLO00592 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PODXLO00592 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PODXLO00592 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PODXLO00592 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PODXLO00592 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PODXLO00592 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PODXLO00592 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PODXLO00592 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PODXLO00592 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PODXLO00592 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PODXLO00592 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PODXLO00592 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXLO00592 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXLO00592 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXLO00592 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXLO00592 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXLO00592 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXLO00592 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXLO00592 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXLO00592 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PODXLO00592 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXLO00592 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXLO00592 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXLO00592 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXLO00592 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXLO00592 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXLO00592 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXLO00592 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXLO00592 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXLO00592 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXLO00592 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXLO00592 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXLO00592 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXLO00592 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXLO00592 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXLO00592 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXLO00592 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXLO00592 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXLO00592 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXLO00592 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXLO00592 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXLO00592 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXLO00592 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXLO00592 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXLO00592 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXLO00592 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXLO00592 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXLO00592 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXLO00592 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms