Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL1O00548 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL1O00548 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL1O00548 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL1O00548 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL1O00548 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL1O00548 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL1O00548 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL1O00548 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL1O00548 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL1O00548 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL1O00548 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL1O00548 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DLL1O00548 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DLL1O00548 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DLL1O00548 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DLL1O00548 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DLL1O00548 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL1O00548 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL1O00548 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL1O00548 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL1O00548 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL1O00548 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL1O00548 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL1O00548 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL1O00548 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL1O00548 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL1O00548 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL1O00548 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL1O00548 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL1O00548 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL1O00548 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL1O00548 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL1O00548 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL1O00548 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL1O00548 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL1O00548 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL1O00548 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL1O00548 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL1O00548 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL1O00548 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL1O00548 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL1O00548 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL1O00548 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL1O00548 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL1O00548 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL1O00548 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL1O00548 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL1O00548 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL1O00548 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL1O00548 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL1O00548 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL1O00548 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL1O00548 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL1O00548 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL1O00548 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL1O00548 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL1O00548 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL1O00548 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL1O00548 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL1O00548 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL1O00548 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL1O00548 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL1O00548 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL1O00548 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL1O00548 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL1O00548 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL1O00548 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL1O00548 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL1O00548 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms