Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA3O00505 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms